Nature Methods | “聚合” 的方法解析蛋白构象景观
随着冷冻电镜技术的进展,数据质量的提升,人们开发一系列计算方法尝试从中获取丰富的蛋白构象分布信息,但是不同的方法得到的构象景观异质性比较强,很难评估其可靠性[2]。
构象 naturemethods 景观 蛋白构象 构象景观 2025-10-01 00:02 1
随着冷冻电镜技术的进展,数据质量的提升,人们开发一系列计算方法尝试从中获取丰富的蛋白构象分布信息,但是不同的方法得到的构象景观异质性比较强,很难评估其可靠性[2]。
构象 naturemethods 景观 蛋白构象 构象景观 2025-10-01 00:02 1
想象一下,你正试图在一场盛大烟火表演的璀璨光芒中,寻找一颗特定颜色的、一闪而过的微弱流星。这几乎是一项不可能完成的任务。烟火的绚烂背景,就像巨大的噪声,将你真正想要观测的信号,那颗流星,完全淹没。
细胞 rna naturemethods mrna 隐身信使 2025-09-24 18:25 2
想象一下,你正凝视着一张百年历史的黑白老照片。照片里有建筑,有人群,轮廓清晰,姿态各异。你能分辨出男女老少,能猜测他们的社会角色,甚至能从建筑风格中读出那个时代的印记。但你永远无法知道,那一刻,照片中每个人心中在想什么,他们在窃窃私语什么,他们身体的每一个细胞
深度学习 naturemethods 形态学 基 ghist 2025-09-21 17:25 2
想象一下,如果你是一位地图绘制师,你的任务是描绘一片广袤而神秘的新大陆。然而,你手中唯一的工具,是一架视野极其狭窄的望远镜。你只能透过它,一次观察一小块区域。你或许能看到一座雄伟的山峰,或是一片宁静的湖泊,但你很难将这些零散的景象拼接成一幅完整的、能揭示大陆全
转录组 naturemethods 病理学 i iscale 2025-09-17 18:25 2
皮肤老化、睡眠差、气血不足、精力下降、记忆力减退等是衰老的常见表征。人类对抗衰老的探索从未停止,在此过程中,中医基于几千年的实践经验积累了独特智慧,而现代医学则凭借科技手段持续取得创新突破。科学界正致力于将二者的优势相结合,通过探索中西抗衰策略的融合与转化应用
视角 细胞 naturemethods doi epub 2025-09-12 08:11 4
我们正处在一个生物学研究的黄金时代。高通量测序技术,特别是单细胞组学(single-cell omics),正以前所未有的分辨率揭示着生命的复杂性。每一个细胞都像一颗独特的星球,蕴藏着独特的遗传信息和功能状态。将数以百万计的细胞信息汇集起来,构建“细胞图谱”(
笔记本 笔记本电脑 naturemethods 星图 海量单 2025-09-11 18:25 4
在人体这个由亿万细胞构成的精密国度里,T细胞无疑是最富传奇色彩的卫士。它们是免疫系统的核心执行者,如同身怀绝技的特种兵,能够精准识别并清除被病毒感染的细胞、狡猾的癌细胞,甚至还能“记忆”曾经的敌人,以便在下次入侵时迅速反应。然而,这些细胞卫士并非千人一面。它们
玄学 naturemethods 定量 聚类 tcat 2025-09-10 17:25 3
生命是如何从一个孤立的受精卵,演化成一个结构复杂、功能协调的有机体的?长久以来,我们习惯于从基因组(Genome)的视角去寻找答案,将DNA视为那本包含了所有指令的“生命天书”。然而,正如一部宏伟的交响乐不仅需要乐谱,还需要乐器和演奏家一样,生命的构建同样离不
naturemethods 脂质 四维 umaia 四维脂质 2025-09-05 18:25 5
我们知道某些基因(编码区)是构建生命的关键章节,但对那些占基因组98%以上、曾被误解为“垃圾DNA”的非编码区,却知之甚少。近年来,全基因组关联研究 (Genome-Wide Association Studies, GWAS) 的浪潮为我们揭示了一个惊人的事
细胞 naturemethods methods 基因表达 2025-09-03 18:26 6
生命是如何运作的?这是一个古老而又永恒的命题。我们知道,蓝图藏在DNA中,信使RNA将其转录,最终由蛋白质这位勤勤恳恳的“工人”来执行几乎所有的生命功能。长久以来,我们认为只要读懂了蛋白质的氨基酸序列,就等于掌握了它的全部秘密。然而,真相远比这复杂。蛋白质并非
蛋白质 深度学习 naturemethods deepmvp 2025-08-29 17:26 5
我们的宇宙中,充满了数以千亿计的星辰,它们通过无形的引力之网彼此相连,构成了一幅宏伟壮丽的图景。当我们将目光投向我们颅骨之内,这里,一个同样复杂甚至更为深邃的宇宙正在上演着自己的传奇。数以百亿计的神经元细胞,如同夜空中的繁星,通过数万亿个突触(Synapses
神经元 疾病 naturemethods 基元 method 2025-08-28 18:26 6
对于胚胎而言,数以万计的细胞,如同初生的星辰,在三维空间中移动、分裂、分化,共同编织出一曲绚丽而复杂的生命交响乐。你想做的,不仅仅是欣赏这壮丽的景象,更是要为每一颗“星辰”绘制一幅精确的星图——记录下它从哪里来,到哪里去,以及它与谁“生”出了新的星辰。这,就是
细胞 naturemethods ultrack metho 2025-08-27 17:26 4
8 月 26 日,东南大学脑科学与智能技术研究院刘力娟研究员课题组联合复旦大学彭汉川教授课题组联合发布了关于小鼠大脑单细胞分辨率联接图谱的研究成果。该成果以“Reconstruction of a Connectome of Single Neurons in
统计学 东南大学 介观 单细胞 naturemethods 2025-08-27 19:43 4
在我们的身体内,一座由亿万细胞构成的生命之城正悄然运转。细胞之间通过一套精密的“秘密电报”系统,即细胞间通讯(Cell-Cell Communication, CCC),来协调行动,共同维系着我们的健康。然而,一旦这套通讯系统出现故障,比如信息错乱或出现恶意信
细胞 naturemethods cellnest meth 2025-06-10 02:28 11
DNA是生命的蓝图,承载着所有遗传信息。但真正让生命“活”起来、执行指令的,是DNA转录出来的RNA。然而,这些RNA分子并非一劳永逸,它们从诞生到消亡,会在细胞内上演一场场精密的“分子舞步”:剪接 (splicing) 决定基因的最终面貌,翻译 (trans
rna naturemethods mrna m relic 2025-06-06 18:26 12
我们体内那些微小的细胞、复杂的组织,乃至宏大的器官,究竟是以怎样精妙的结构在运作?现代生物医学研究,正以前所未有的速度迈入三维(3D)成像时代,试图揭开生命更深层次的奥秘。然而,这场探索并非坦途。
naturemethods interpolai 光流魔法 2025-06-03 06:28 13
我们体内数万亿个细胞,它们如何各司其职,从最初的单一受精卵分化出肌肉、神经、免疫等千差万别的细胞类型?又或者,当疾病来袭,细胞内部的“指令”为何会出错?这一切的奥秘,都隐藏在一个极度复杂而精密的“指挥中心”——基因调控网络 (gene regulatory n
范式 单细胞 naturemethods 双剑 atac 2025-05-29 18:27 12
为解决 3D 基因组染色质拓扑结构调控因子研究受限,缺乏高效筛选技术的问题,研究人员开展了名为 Perturb-tracing 的技术研究。他们发现众多新调控因子,研究成果发表在《Nature Methods》上明确其多尺度作用及与已知机制关联,还揭示染色质压
解锁 naturemethods 基因组 染色质 tad 2025-05-25 10:51 11
我们的大脑,这个宇宙中最复杂的结构,其奥秘隐藏在数十亿神经元(neurons)之间,它们以毫秒级的高速电信号(Action Potentials, APs)进行着无休止的“对话”,构建出我们感知、思考和记忆的宏伟图景。长期以来,研究人员梦寐以求的,就是能“看清
千里眼 神经元 naturemethods methods 2025-05-24 18:27 9
你是否曾惊叹于荧光显微镜下那些被点亮的生命图景?通过各种荧光染料或蛋白,我们得以窥见细胞的结构、蛋白的位置,仿佛给生命穿上了五彩的外衣。荧光显微镜无疑是现代生命科学的基石。
指纹 解密 显微镜 naturemethods 振动显微镜 2025-05-21 18:28 14