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Nature Methods | u-Segment3D的升维破局:当二维“切片”拥有三维视野,细胞分割的“次元壁”被打破

生命,在其最本真的状态下,是一个三维的存在。从单个细胞的精微结构,到组织器官的复杂构型,再到生命系统整体的动态演化,空间维度定义了功能的起点。近年来,显微成像技术的飞跃,特别是光片照明显微镜 (light-sheet microscopy) 和组织透明化技术的

细胞 次元壁 切片 naturemethods method 2025-11-13 18:25  1

Nature Methods | 解码细胞命运:CytoTRACE 2,一眼看穿单细胞的前世今生

生命,是一部宏伟的交响乐。从一个受精卵(Zygote)开始,音符(细胞)不断分裂、分化,最终奏响了构成复杂有机体的华美乐章。在这个过程中,一个核心问题始终萦绕在研究人员的心头:细胞是如何知道自己将要成为什么?一个神经元为何没有变成皮肤细胞?一个干细胞又如何保留

细胞 单细胞 naturemethods cytotrace 2025-10-29 21:25  1

Nature Methods | 破译RNA的折叠密码:当进化“剧透”了三维结构的秘密

DNA通常被誉为“生命蓝图”的总导演,而蛋白质则是那些在舞台上执行各种复杂任务的明星演员。那么,RNA(核糖核酸)是什么角色?在很长一段时间里,它被看作是连接两者的谦卑信使。然而,这个观念早已过时。我们现在知道,RNA不仅传递信息,它本身就是一位多才多艺的演员

rna 剧透 naturemethods 基序 method 2025-10-07 17:25  3

Nature Methods | 超越形态学边界:GHIST深度学习框架实现从细胞结构到基因功能的精准预测

想象一下,你正凝视着一张百年历史的黑白老照片。照片里有建筑,有人群,轮廓清晰,姿态各异。你能分辨出男女老少,能猜测他们的社会角色,甚至能从建筑风格中读出那个时代的印记。但你永远无法知道,那一刻,照片中每个人心中在想什么,他们在窃窃私语什么,他们身体的每一个细胞

深度学习 naturemethods 形态学 ghist 2025-09-21 17:25  4

Nature Methods | 当百年病理学遇见AI:iSCALE赋能H&E图像,预测细胞级空间转录组

想象一下,如果你是一位地图绘制师,你的任务是描绘一片广袤而神秘的新大陆。然而,你手中唯一的工具,是一架视野极其狭窄的望远镜。你只能透过它,一次观察一小块区域。你或许能看到一座雄伟的山峰,或是一片宁静的湖泊,但你很难将这些零散的景象拼接成一幅完整的、能揭示大陆全

转录组 naturemethods 病理学 i iscale 2025-09-17 18:25  4

抗衰新视角:从“精气血”理论到中式细胞延衰新方案

皮肤老化、睡眠差、气血不足、精力下降、记忆力减退等是衰老的常见表征。人类对抗衰老的探索从未停止,在此过程中,中医基于几千年的实践经验积累了独特智慧,而现代医学则凭借科技手段持续取得创新突破。科学界正致力于将二者的优势相结合,通过探索中西抗衰策略的融合与转化应用

视角 细胞 naturemethods doi epub 2025-09-12 08:11  9

Nature Methods | 解锁细胞宇宙的“星图”:scvi-hub如何将海量单细胞数据“浓缩”到你的笔记本电脑里?

我们正处在一个生物学研究的黄金时代。高通量测序技术,特别是单细胞组学(single-cell omics),正以前所未有的分辨率揭示着生命的复杂性。每一个细胞都像一颗独特的星球,蕴藏着独特的遗传信息和功能状态。将数以百万计的细胞信息汇集起来,构建“细胞图谱”(

笔记本 笔记本电脑 naturemethods 星图 海量单 2025-09-11 18:25  6

Nature Methods | 告别聚类“玄学”:TCAT为T细胞研究带来可定量、可比较的分析新时代

在人体这个由亿万细胞构成的精密国度里,T细胞无疑是最富传奇色彩的卫士。它们是免疫系统的核心执行者,如同身怀绝技的特种兵,能够精准识别并清除被病毒感染的细胞、狡猾的癌细胞,甚至还能“记忆”曾经的敌人,以便在下次入侵时迅速反应。然而,这些细胞卫士并非千人一面。它们

玄学 naturemethods 定量 聚类 tcat 2025-09-10 17:25  5