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Nature Methods | 超越形态学边界:GHIST深度学习框架实现从细胞结构到基因功能的精准预测

想象一下,你正凝视着一张百年历史的黑白老照片。照片里有建筑,有人群,轮廓清晰,姿态各异。你能分辨出男女老少,能猜测他们的社会角色,甚至能从建筑风格中读出那个时代的印记。但你永远无法知道,那一刻,照片中每个人心中在想什么,他们在窃窃私语什么,他们身体的每一个细胞

深度学习 naturemethods 形态学 ghist 2025-09-21 17:25  2

Nature Methods | 当百年病理学遇见AI:iSCALE赋能H&E图像,预测细胞级空间转录组

想象一下,如果你是一位地图绘制师,你的任务是描绘一片广袤而神秘的新大陆。然而,你手中唯一的工具,是一架视野极其狭窄的望远镜。你只能透过它,一次观察一小块区域。你或许能看到一座雄伟的山峰,或是一片宁静的湖泊,但你很难将这些零散的景象拼接成一幅完整的、能揭示大陆全

转录组 naturemethods 病理学 i iscale 2025-09-17 18:25  2

抗衰新视角:从“精气血”理论到中式细胞延衰新方案

皮肤老化、睡眠差、气血不足、精力下降、记忆力减退等是衰老的常见表征。人类对抗衰老的探索从未停止,在此过程中,中医基于几千年的实践经验积累了独特智慧,而现代医学则凭借科技手段持续取得创新突破。科学界正致力于将二者的优势相结合,通过探索中西抗衰策略的融合与转化应用

视角 细胞 naturemethods doi epub 2025-09-12 08:11  4

Nature Methods | 解锁细胞宇宙的“星图”:scvi-hub如何将海量单细胞数据“浓缩”到你的笔记本电脑里?

我们正处在一个生物学研究的黄金时代。高通量测序技术,特别是单细胞组学(single-cell omics),正以前所未有的分辨率揭示着生命的复杂性。每一个细胞都像一颗独特的星球,蕴藏着独特的遗传信息和功能状态。将数以百万计的细胞信息汇集起来,构建“细胞图谱”(

笔记本 笔记本电脑 naturemethods 星图 海量单 2025-09-11 18:25  4

Nature Methods | 告别聚类“玄学”:TCAT为T细胞研究带来可定量、可比较的分析新时代

在人体这个由亿万细胞构成的精密国度里,T细胞无疑是最富传奇色彩的卫士。它们是免疫系统的核心执行者,如同身怀绝技的特种兵,能够精准识别并清除被病毒感染的细胞、狡猾的癌细胞,甚至还能“记忆”曾经的敌人,以便在下次入侵时迅速反应。然而,这些细胞卫士并非千人一面。它们

玄学 naturemethods 定量 聚类 tcat 2025-09-10 17:25  3

Nature Methods | 生命的“油”画:uMAIA解码发育的四维脂质图谱

生命是如何从一个孤立的受精卵,演化成一个结构复杂、功能协调的有机体的?长久以来,我们习惯于从基因组(Genome)的视角去寻找答案,将DNA视为那本包含了所有指令的“生命天书”。然而,正如一部宏伟的交响乐不仅需要乐谱,还需要乐器和演奏家一样,生命的构建同样离不

naturemethods 脂质 四维 umaia 四维脂质 2025-09-05 18:25  5

Nature Methods | 当深度学习遇见纯净数据:DeepMVP为精准医学画出蛋白质功能新图谱

生命是如何运作的?这是一个古老而又永恒的命题。我们知道,蓝图藏在DNA中,信使RNA将其转录,最终由蛋白质这位勤勤恳恳的“工人”来执行几乎所有的生命功能。长久以来,我们认为只要读懂了蛋白质的氨基酸序列,就等于掌握了它的全部秘密。然而,真相远比这复杂。蛋白质并非

蛋白质 深度学习 naturemethods deepmvp 2025-08-29 17:26  5

Nature Methods | 从模糊到清晰:绘制单神经元连接组,迈向理解大脑疾病的关键一步

我们的宇宙中,充满了数以千亿计的星辰,它们通过无形的引力之网彼此相连,构成了一幅宏伟壮丽的图景。当我们将目光投向我们颅骨之内,这里,一个同样复杂甚至更为深邃的宇宙正在上演着自己的传奇。数以百亿计的神经元细胞,如同夜空中的繁星,通过数万亿个突触(Synapses

神经元 疾病 naturemethods 基元 method 2025-08-28 18:26  6

Nature Methods | 拥抱不确定性:Ultrack用“选择困难症”智慧破解细胞追踪难题

对于胚胎而言,数以万计的细胞,如同初生的星辰,在三维空间中移动、分裂、分化,共同编织出一曲绚丽而复杂的生命交响乐。你想做的,不仅仅是欣赏这壮丽的景象,更是要为每一颗“星辰”绘制一幅精确的星图——记录下它从哪里来,到哪里去,以及它与谁“生”出了新的星辰。这,就是

细胞 naturemethods ultrack metho 2025-08-27 17:26  4

Nature Methods | 告别“猜谜”式研究:CellNEST为细胞通讯分析带来前所未有的精准度与深度

在我们的身体内,一座由亿万细胞构成的生命之城正悄然运转。细胞之间通过一套精密的“秘密电报”系统,即细胞间通讯(Cell-Cell Communication, CCC),来协调行动,共同维系着我们的健康。然而,一旦这套通讯系统出现故障,比如信息错乱或出现恶意信

细胞 naturemethods cellnest meth 2025-06-10 02:28  11

Nature Methods | “双剑合璧”!SUM-seq重塑单细胞多组学图谱,引领科研新范式

我们体内数万亿个细胞,它们如何各司其职,从最初的单一受精卵分化出肌肉、神经、免疫等千差万别的细胞类型?又或者,当疾病来袭,细胞内部的“指令”为何会出错?这一切的奥秘,都隐藏在一个极度复杂而精密的“指挥中心”——基因调控网络 (gene regulatory n

范式 单细胞 naturemethods 双剑 atac 2025-05-29 18:27  12

Nature Methods | 超分辨“千里眼”:ALI技术如何穿透大脑“迷雾”,看清每个神经元的电活动?

我们的大脑,这个宇宙中最复杂的结构,其奥秘隐藏在数十亿神经元(neurons)之间,它们以毫秒级的高速电信号(Action Potentials, APs)进行着无休止的“对话”,构建出我们感知、思考和记忆的宏伟图景。长期以来,研究人员梦寐以求的,就是能“看清

千里眼 神经元 naturemethods methods 2025-05-24 18:27  9